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基因與基因組

生化之美   2018-01-01    A20180101006
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❒ 基因(Gene)
某一段DNA,可以形成一個具有完整功能的RNA或蛋白質,則我們稱這段DNA為一個「基因(Gene)」,我們分成下面兩種情形說明:
某一段DNA(可能有數百個A、T、G、C),可以轉錄成mRNA,並且轉譯成某一種蛋白質,我們就稱這一段DNA是一個基因。
如<圖一(a)>所示,人類的第17號染色體共有92Mbp(百萬鹼基對),假設其中有一段DNA序列為ATG-GAG-GTG,可以形成蛋白質「Met-Glu-Val」,而這個蛋白質具有完整的功能,我們就稱這一段DNA序列ATG-GAG-GTG是一個基因。
某一段DNA(可能有數百個A、T、G、C),可以轉錄成rRNA或tRNA,而這個rRNA或tRNA具有完整的功能,可以協助mRNA產生蛋白質,我們就稱這一段DNA是一個基因。
如<圖一(b)>所示,人類的第17號染色體共有92Mbp(百萬鹼基對),假設其中有另外一段DNA序列為TGC-TAT-TAA,可以形成rRNA或tRNA「UGC-UAU-UAA」,而這個rRNA或tRNA具有完整的功能,我們就稱這一段DNA序列TGC-TAT-TAA是一個基因。

 

圖一 基因的意義。

 

❒ 澱粉酶
人體的唾液內含有澱粉酶,澱粉酶是一種可以將澱粉轉變成醣的蛋白質,而這種蛋白質必定是由唾腺細胞內,的細胞核內,的染色體內,的某一段DNA(可能有數百個A、T、G、C),經由轉錄與轉譯所產生,所以我們就稱這一段可以產生澱粉酶的DNA為一個「基因」。同理,胃蛋白酶必定有一個相對應的基因、胰島素必定有一個相對應的基因,甚至人體裡控制高矮胖瘦的酵素必定也有相對應的基因,控制聰明愚笨的酵素必定也有相對應的基因,顯然基因掌握了一個人的一切。

 

❒ 基因組(Genome)
生物體內的遺傳物質(所有的DNA),所含有的全部遺傳訊息(所有的基因),我們稱為「基因組(Genome)」。通常原核生物(例如:大腸桿菌)的DNA只有一個環形分子;而真核生物(例如:人類或樹木)的DNA形成數個染色體分布在細胞核內。

 

❒ B型肝炎病毒的基因
B型肝炎病毒的DNA具有雙股結構,但是兩股一長一短,如<圖二>所示,其中長股有3020~3320個鹼基,短股有1700~2800個鹼基,這兩股DNA總共只有4個基因:
➤S基因:產生的蛋白質可以形成病毒的包膜。
➤C基因:產生的蛋白質可以形成病毒的核殼。
➤P基因:產生的蛋白質可以形成病毒的聚合酶。
➤X基因:產生的蛋白質負責病毒的調節作用。

 

圖二 B型肝炎病毒的基因。
資料來源:李權益,分子生物學,合記圖書出版社。<我要買書

 

<表一>列出幾種常見生物的基因組,其中B型肝炎病毒的DNA長度大約3.2 Kbp,只有4個基因;愛茲病毒(HIV-1)的DNA長度大約9.7Kbp,只有9個基因;大腸桿菌的DNA長度大約4.6Mbp,只有4380個基因;酵母菌的DNA長度大約12Mbp,只有6340個基因;果蠅的DNA長度大約150Mbp;玉米的DNA長度大約2100Mbp;人類的DNA長度大約3000Mbp,大約有30000個基因。由表中可以看出,愈高等的生物,DNA的長度愈長,基因的數目也愈多,代表可以產生的蛋白質種類愈多。

 

表一 幾種常見生物的基因組。

資料來源:李權益,分子生物學,合記圖書出版社。<我要買書


此外,這個世界就是這麼有趣,B型肝炎病毒只有4個基因,愛滋病毒只有9個基因,但是這麼少的基因所產生的蛋白質卻可以殺死比它大許多的人類。還記得在迪士尼的動畫電影「恐龍(Dinosaur)」的最開始,就說了一段寓意深遠的話:有些事物的起源壯闊巨大,有些卻源於細微之處,非常細微,但有時最細微的事物,卻能造成最巨大的改變。想一想,我們的人生是不是也一樣呢?一念為善、一念為惡,起心動念,實細微矣!有一部電影叫做「蝴蝶效應(The Butterfly Effect)」,其實談到的就是科學上一個很有趣的理論,有科學家認為,南美洲颶風(颱風)的發生,其實是由於某處的一隻小蝴蝶,因為翅膀抖動了一下,產生了一陣微小的旋風,結果在某個巧合的情況下與周圍的氣流產生共振,最後形成颶風,這個理論雖然還沒有足夠的證據,但是意思也是:最細微的事物,卻能造成最巨大的改變囉!

 

❒ 人類基因組計劃
人類基因組計劃是由美國能源部與國家衛生研究院贊助的計畫, 於1991年開始執行,之所以會和能源部有關,是因為早期美國能源部想要了解核能與人類基因突變的關係,後來才與國家衛生研究院合作,由於人類的染色體總共有30億個鹼基對,而且世界上不同國家的人其實差異不大,如果每個國家都重覆進行基因解碼的工作實在沒有什麼意義,所以就由美國贊助費用,將人體23對(46條)染色體分給每個國家拿回去研究,以美國為首和英、德、法、日等十五個國家,超過六十個大學與研究機構參與這項計畫,台灣的研究機構也有貢獻唷!
人類基因組計劃目前己經順利解出人類染色體30億個鹼基對的核苷酸序列,以及大部分的基因,最後被解碼出來的是人類最長的第1號染色體,並且於2006年5月發表,重點整理如下:
基因組通常只計算相異的基因,相同的部分略去不算,人類染色體總共有23對(46條),由於每對相似染色體的基因很相似,所以人類的基因組只計算23條染色體(A、B、C…等)的DNA與粒線體DNA,總共大約有30000個基因。
人類的染色體有30億個鹼基對(3000Mbp),其中大約有30000段DNA可以形成具有完整功能的RNA或蛋白質,所以大約有30000個基因,但是這些基因的總長度大約只有750Mbp,換句話說,只有大約25%的DNA是有用的。
人類的染色體有30億個鹼基對(3000Mbp),不同人的差異大約只有300~500萬個鹼基對(3~5Mbp),因此不同人鹼基對的差異只有大約0.1%,相似性高達99.9%。

 

❒ 人類體內的蛋白質種類
人類的染色體總共大約有30000個基因,也就是可以產生大約30000種不同的蛋白質,但是不同種類的蛋白質又可以交叉反應,所以最後可以產生大約10萬種蛋白質。例如:基因A可以形成蛋白質A、基因B可以形成蛋白質B,而蛋白質B恰好是一種酵素,酵素可以引發生物體內的生化反應,結果蛋白質A在蛋白質B的催化之下,產生蛋白質C,顯然因為有些蛋白質是酵素,所以30000種不同的蛋白質交叉反應可以產生大約10萬種蛋白質。

 

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